Kelebihan dan Keunggulan MTs Wachid Hasyim Surabaya yg benar-benar sebagai pembeda khas:
1. MTs. Wachid Hasyim merupakan Pilot Project Nasional Madrasah inklusif dan MTs swasta terbaik di wilayah Utara-Barat Surabaya dengan 561 peserta didik dan 32 guru Satminkal semuanya sesuai kualifikasi akademik, tidak ada guru yang mismatch.
2. MTs Wachid Hasyim Surabaya telah melaksanakan Program Pendidikan Inklusif (Education for All) sebelum Kementerian Agama membuka Program Madrasah Inklusif.
3. MTs. Wachid Hasyim Surabaya menjalankan program pembelajaran berbasis digital (IT) sejak tahun 2015, jauh sebelum pembelajaran Daring di musim Pandemi Covid 19.
4. Administrasi pembelajaran dan penilaian tersedia lengkap dan disimpan rapi di http://www.mtswachidhasyimsby.com/ yang bisa dan biasa diakses oleh MTs lain se-Indonesia.
5. Program GEFA, GEMI, GELEM telah berjalan secara terprogramdan terukur sebelum Kanwil Kemenag Jatim meluncurkan program GERAMM;
6. Hampir semua Sarana dan Prasarana Pendidikan telah sesuai dengan Standar Nasional Pendidikan.
7. Prestasi Akademik dan Non Akademik peserta didik telah mewarnaiprestasi madrasah di Surabaya. Prestasi dimaksud telah diraih peserta didik di ajang kompetisi baik yg diselenggarakan Dinas Pendidikan, Kankemenag maupun institusi lainnya.
8. MTs Wachid Hasyim didukung oleh tenaga kependidikan, sepertikepala madrasah, para Wakamad, staff Wakamad, dan staff administrasi yang kompeten ksrena sesuai kualifikasi akademik yang dipersyaratkan.
9. MTs. Wachid Hasyim Surabaya secara konsisten dan terprogram melakukan Pengungkapan kompetensi tersembunyi (hidden competency exposure) Wakamad dan staff, guru, walkel dan tenaga kependidikan lainnya. Cara ini sebagai penguat terhadap 5 kompetensi umum yg harus dikuasai oleh Kamad beserta unsur pimpinan, dan 4 kompetensi yg wajib dimiliki serta diterapkan oleh guru dengan semboyan Kerja Ikhlas, Kerja Keras, dan KerjaTuntas mulai pukul 07.00 -13.00 WIB. Waktu kerja ini berlaku bagi semua guru dan unsur lainnya setiap hari kerja tanpa memandang jabatan, senioritas dan take home pay.